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データベース

データベース名概要関連論文担当調査結果
NCBI Bioinformatics Center   
EMBL Bioinformatics Center   
PubMed Biomedical literature   
GenBank Nucleic acid sequence
SRS at EMBL/EBI Nucleic acid sequence
Entrez Genome Genome sequence
TIGR database Genome sequence
GenBank (protein) Protein sequence
SWISS-PROT at ExPASy Protein sequence
PIR Protein sequence http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html
Protein Data Bank Protein sequence
RESID Post-translational modifications http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html
ENZYME Biochemical and biophysical information
BIND Biochemical and biophysical information
KEGG Biochemical pathways http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg1.html
OMIM Disorders Database
LocusLink Gene information
PubGene MedLineから自動抽出したヒトイデンッし発現量DB http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html
PartsList アミノ酸立体構造予測 http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750
InterPro プロテオーム関連DB http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf
FullLengthcDNA HumanのFull Length cDNA8000本
ATCC STR(Short Tandem Repeat) and cDNA database
World data centre for Microorganisms Microbial database
JFCCバクテリア、ウイルス Culture collection
NCCB mutant strains
SRS EMBLE database search
Codon Usage Database Database of Codon usages
SANGER Portal site for bioinformatics
genbank updata GenBank Updata information
JSNPs 日本人SNPsDB
シロイヌナズナデータベース シロイヌナズナゲノムデータベース
HGREP ヒトゲノム再構築プロジェクト
dbSNP NCBIのSNPデータベース

リンク

データベース名概要関連論文
DatabaseList ゲノム解析班のデータベースリスト
NAR Database NARデータベース特集
tool_db.txt · Last modified: 2014/01/18 07:44 (external edit)